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科研服务

病毒基因组测序

病毒(Virus)由一种核酸分子(DNARNA)与蛋白质(Protein)构成或由蛋白质构成(如 朊病毒)。根据遗传物质的组成,可分为单链 DNA 病毒(ssDNA)、双链 DNA  病毒(dsDNA)、单链 RNA 病毒(ssRNA)、双链 RNA  病毒(dsRNA)和蛋白质病毒(如朊病毒)。根据宿主类型的不同,可以分为噬菌体(细菌病毒)、植物病毒(烟草花叶病毒)和动物病毒(如禽流感病毒、天花病毒和HIV等)。


病毒全基因组测序(Virus  Whole  Genome   SequencingVWGS),是指基于二代高通量测序技术,对病毒全基因组进行测序,利用生物信息分析手段,得到病毒的全基因组序列,解析编码信息,并获得相应的变异信息。



产品参数




产 品

文库插入片段大小(bp)

测序平台及测序模式

测序深度

交付指标

项目周期

痕量单链RNA病毒测序 A

300 ~ 500

Illumina MiSeq,PE251

~100 ×

数据量

30 个自然日

痕量单链RNA病毒测序 B

300 ~ 500

Illumina HiSeq,PE150

~100 ×

数据量

40 个自然日

常规单链RNA病毒测序 A

300 ~ 500

Illumina MiSeq,PE251

~100 ×

数据量

30 个自然日

常规单链RNA病毒测序 B

300 ~ 500

Illumina HiSeq,PE150

~100 ×

数据量

40 个自然日

常规双链DNA病毒测序 A

300 ~ 500

Illumina MiSeq,PE251

~100 ×

数据量

30 个自然日

常规双链DNA病毒测序 B

300 ~ 500

Illumina HiSeq,PE150

~100 ×

数据量

40 个自然日


* 测序深度:推荐的测序深度指目标病毒基因组的测序深度,具体测序数据量计算参见“病毒基因组测序数据量估算”;

1 痕量病毒:指核酸量在10 ng~200 ng的病毒样品


样品要求



image.png


*病毒类样本不接受原样送样,只接收核算样品,及DNA病毒仅接受提取好的双链DNA,RNA病毒仅接受反转录好的双链cDNA。