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群落多样性组成谱测序

群落多样性组成谱测序

群落多样性组成谱测序以细菌 / 古菌 16S rRNA 基因可变区、真菌 18S r RNA 基因可变区或真菌 ITS(Internal transcribed  spacer)内转录间隔区等微生物特征序列(Signature sequence)为靶点,通过检测序列的变异和数量,反映群落 中各类微生物物种的身份和丰度,从而快速解析群落物种分布特征,阐明样本间多样性和组成差异,进而发现差异相 关物种。


产品特点

1. 直接对群落样本中的微生物特征序列进行扩增检测,简单快速,并克服了大部分微生物无法

纯培养的难题;

2. 自动化、专业的 DNA 提取流程,配合高保真 DNA 聚合酶进行 PCR 扩增,并严格把控扩增循环数,确保

群落组成客观真实;

3. 使用 Illumina NovaSeq/MiSeq 和 PacBio Sequel II 进行测序, 2×250 bp、2×300 bp、>1 kb 的多种长

度均可适配,每个样本都能一次性获得数万条序列,即使低丰度物种也能定量;

4. 采用 QIIME 2 分析流程, DADA2、物种注释、PICRUSt2 功能潜能预测等方法覆盖;

5. 提供分析结果,和发表等级的动态交互可视化效果。



项目流程

微生物组总DNA提取→目标片段PCR扩增→扩增产物检测定量→测序文库制备→上机进行高通量测序→生信分析


分析内容

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